16SrRNA的预测与鉴定

16S  rRNA作为微生物的特征片段,在鉴定微生物物种的过程中起着重要的作用。我们在做宏基因组分析的时候可以找一下scaffolds中的16S  rRNA,然后跟数据库比对,看里面都有什么物种;或者我们直接对环境样品进行16S  rRNA 高通量测序,然后来获知该环境样品的群落组成。总之16srRNA的分析很重要。本博文将围绕16S  rRNA的预测与鉴定两部分展开。

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R简介与安装

一 简介

R是一个非常灵活的集合命令行,程序语言,图形界面一体的统计和作图的免费的工具。R是S的方言。S语言是于1976妮娜由Bell 实验室开发的,刚开始并没有统计模型;1933年的时候,Bell 实验室卖掉了S语言;2004年,Isightful从Lucent花2百万美元买了过来,并成为现在的老板。

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写在入职前

走出客车站那一刻,我知道苏州肯定不是我理想的城市,弥漫的灰尘、焦灼的空气。有很多理由说服自己去选择这家刚成立的公司,比如:软银的风投;人类基因组计划参与者、见证并参与illimina成长的大牛、千人计划者;我需要一个环境完成我从科研到转化医学的转型;一个充满挑战与危机的机会。我甚至也有很多理由让我拒绝这份工作:陌生的城市;未知的前途;不正规的管理;一切从头的友情。在有很多机会选择的时候,我不选择离家近点,不选择可能稍微安逸的大公司,不选择北京户口,不选择高薪,我想我脑子可能又抽风了。

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道道,诉给自己听

连续几天的火锅,几通电话,简单的几个短信,也能搞得我一把鼻涕一把泪,粗糙的外表下居然有这么温润的心啊。我知道我是一个不善“经营”(这个词有点俗了)关系的人,我不知道未来是否还能彼此无障碍的交心,但此刻,我知道,我们是没有失落的。

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