【6.2】抗体编号系统(CCG/Kabat/Chothia/IMGT )

  1. Kabat Numbering和Eu Numbering是两回事。

  2. Eu是指上个世纪60年代末(1968)Gerald M.Edelman(因抗体序列结构方面的研究得过诺贝尔奖)等人分离纯化得到一个人IgG1免疫球蛋白,命名为Eu,并测定了其氨基酸序列并遍了号,就被沿用为Eu Numbering,现在已经很少使用了。

  3. Kabat Numbering应该是在Eu Numbering的基础上结合更多的Ig序列进行了改善后的编号系统,也是迄今仍广为使用的抗体序列编号系统。

  4. 现在有几套抗体编号系统在并行使用,经典的Kabat,Chothia编号,IMGT编号;还有一些使用面较小的编号系统。

  5. 各编号系统的对比:http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/#B

  6. 下图对比了抗体C domain的IMGT、kabat及Eu编号:http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/Numbering/Hu_IGHGnber.html

MOE中操作:

SEQ – 粘贴序列 – annotate - antibody – CCG/Kabat/Chothia/IMGT

参考资料:

http://www.dxy.cn/bbs/thread/35439553#35439553

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