【6.4.6】底物类似物(Substrate Analogue)

该类抑制剂不仅具有与底物相似的、可与酶结合的基团,同时还有一个能与酶的其他基团反应的活泼基团。这种抑制剂虽然主要与酶活性部位的必需基团起反应,但可以修饰酶其他部位的同一基团,因此其专一性有一定限度。这取决于抑制剂与酶活性部位必需基团在反应前形成非共价络合物的解离常数和抑制剂与非活性部位同类基团形成的非共价络合物之间的解离常数之比。

例如,N-对-甲苯磺酰-L-苯丙氨酰氯甲基酮(TPCK)与胰凝乳蛋白酶的最佳底物N-对-甲苯磺酰-L-苯丙氨酸甲酯的结构相似,都含有N-对-甲苯磺酰-L-苯丙氨酰基,酶把TPCK误认为底物而与之结合,形成Ks很小的非共价络合物。

TPCK 上的-CH2-Cl与酶活性部位的一个His残基上的咪唑基团距离很近,很易使之烷基化,而非活性部位的咪唑基,由于远离-CH2-Cl,则不被烷基化。

  • 与底物相似,所以结合在酶活性中心(Resembles substrate and binds at the enzyme active site)
  • 但带有反应性基团,故一旦进入活性中心,可共价修饰活性中心,导致 酶不可逆地失活

参考资料

  • 南京大学 杨荣武老师 《结构生物学》课件
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