ncRNA注释–Rfam

一 Rfam 简介

Rfam 是一个数据库,用于鉴定non-coding RNAs。由多重序列比对(multiple sequence alignments)和协方差模型(covariance models,CMs)代表。Rfam的主要目的是使用敏感BLAST过滤器连同CMs,对核苷酸序列,特别是完整基因组,注释已知RNA家族的新成员。具有一个非常广泛的分类学区域的少数家族(例如,tRNA和rRNA)提供了大多数的序列注释,同时大多数Rfam家族(例如,snoRNAs和miRNAs)具有有限的分类范围,并提供了有限数目的注释。

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