tRNA的预测–tRNAscan-SE

1. tRNAscan-SE 简介

tRNAscan-SE 能在基因组水平上进行tRNA扫描。该软件实际上是一个perl 脚本,整合了tRNAscanEufindRNACove 这3个独立的tRNA检测软件。tRNAscan-SE 首先调用 tRNAscan和EufindRNA鉴定基因组序列中 tRNA区域,然后调用Cove进行验证。这样既保证了前者的sensitivities, 又保证了后者较低的假阳性概率,同时在搜索速度上提升了很多。

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