Linux【1.3】痛苦的ubuntu安装

准备开展生物信息学方面的工作,今后需要用到Arb等只能在LINUX上运行的软件。

一开始以为LINUX就是像windows那样没有几个版本,选择最新的安装就可以了,这才发现LINUX有好多好多的版本啊,而且不同的版本有不同的特色,我最后选择的是Ubuntu。原因很简单,因为用的人多,相关的论坛成熟一点,这样对我一个新手来说入门更快一点。

版本敲定了,然后就是下载软件,安装的事情了。Ubuntu是半年更新一次,例如版本号是12.04,则代表是12年4月份出来的。我选择的是12.04,32位的(下载地址http://www.ubuntu.com.cn/,在Ubuntu的论坛上也可以下载http://forum.ubuntu.org.cn/viewforum.php?f=77&sid=8959974c3dd5cfdb427bbc99addbb023)

安装LINUX系统的方式大体上可以分为3种:

  • wubi安装(wubi是基于windows系统上安装的,wubi相当于windows上的一个程序,通过卸载wubi可以卸载ubutu);
  • 虚拟机安装(相当于在电脑的硬盘上再划分一个区域出来装一个系统,也就是所谓的双系统)
  • 整个系统

一、选择wubi

因为即使第一次安装的不好,我这种菜鸟也不会把电脑给弄坏,影响正常的学习工作。

下载下来的12.04iso压缩文档解压出来里面的wubi,两个文件放在一个根目录下,iso改名为installion.iso,拔掉网线,双击wubi安装

出现自动不停下载的问题

解决:进入iso的casper,重命名vmlinuz为vmlinuz.efi,还有必须还保留vmlinuz

出现Busybox

解决: 将iso中的disk.caper拷贝到wubi和iso所在的目录下,再运行wubi 出现apt.configuration 和loop_moutde file system already present

未解决(如果有大神看到我这个帖子,有办法可以告诉我,我尝试了很多网上介绍的方法,都不行,毕竟是菜鸟,求带)

二、MV安装

安装方法百度文库里面有很多图文并茂的方法,傻瓜式的按上面来就行(比如说这个地址讲的就很具体http://wenku.baidu.com/view/1d49aec02cc58bd63186bd23.html)。

operation could not found 我怀疑是前不久重装XP系统后对硬盘分区的后遗症 下载PQ10 但实验室破电脑用不了10,所以又重新下载了pq8.0(具体使用方法网上有很多教程) 将D盘设为了活动(我把虚拟机装在了D盘)

然后出现 error loading operating system ,开机重启后进入不了windos系统

只有用系统盘,通过系统盘找问题 各种尝试后 最后 通过系统盘的“系统维护DOS工具等” A: spfdisk 取消D盘为活动盘,c盘设为唯一的活动,并显示隐蔽区分(就是这一步,因为我给C盘多分区的时候没有注意到的地方) 又能进入window系统,重新开始解决 operation could not found

最后发现只要将iso放在D盘,即虚拟机安装的位置,然后安装,就大功告成了

现在的问题是vmtools安装不上,可能是因为我用的是汉化版的vm的缘故吧,不过总算可以享受ubuntu带来的快感了

几个晚上的功夫总算有点成效,给自己赞一个!

三、整个系统

四、ubuntu图形界面的安装

昨天接手我们实验室最贵的仪器,价值140万的ion测序仪,因为新鲜所以激动,又因为自己的无知,而倍感压力。从自己决定挑战生信开始,就明白以后的日子不会好过。昨天下午去川大请教敬师兄(一个很有想法的博士)关于一些服务器,ubuntu,perl,R的问题,第一次见面,因为自己没有很好的准备,也没有太多技术上的交流。他也是从零开始,一步一步摸索的,所以给了我很大的信心。我觉得,要想在技术上有很核心的竞争力,对于个人而言,必须经过一段时间的沉浸,这个跟天赋的关系不是太大,只有经过沉浸的东西才不是每个人都能做到的,才会显得有力量。行啦,废话就不说了,决定通过博客记录自己学习的过程,让SINA见证我的专业成长之路吧。

我们实验室用的是T7500的服务器,系统是ubuntu10.04,因为是服务器,所以没有图形界面,作为一个资深菜鸟,我还是想给他装上图形界面。今日操作如下:

1.联网(接手的时候,服务器就是已经能上网的了)

2.开机后输入图形界面的命令 startx,提示安装xinit

sudo apt-get install xinti 
安装完后终端由黑色变成了白底黑字,出现X型的鼠标指针
ps:我的显示的是已经安装上了,写上上面的步骤方便后来之人

3.安装环境管理器

sudo apt-get install gdm (gdm代表的是genome图形界面)
E:unable to fetch some archives,maybe run apt-get upadate or try with --fix-missing
    我选择 :sudo try with --fix-missing
command not found每日一生信---ubuntu图形界面的安装
     : sudo fix-missing
command not found 每日一生信---ubuntu图形界面的安装
      :sudo apt-get update
      :sudo apt-get install gdm
idconfig deferred processing now taking place 安装成功

4.安装桌面环境

sudo apt-get install kubuntu-desktop   选择kubuntu就是因为相信了网友的推荐,说这个有终       端,建议安装这个,这位后面的故事埋下了伏笔。这个安装的过程大概30分钟,跟网速有关系,最后我选       择gdm界面。
重启  sudo init 6  重启 
ps:  init 相关的选项  0   停机 
           1   单用户模式
           2   多用户,没有NFS
           3    完全多用户模式(标准的运行级)
           4    没有用到
           5    x11
           6    重新启动

5.重启后我们看到了kubuntu界面了 这下我傻眼了,这个界面跟我之前用到的ubuntu看上去差别太大了

Ctrl+Alt+T没有打开terminal
       sudo apt-get install language-support-zh  (语言包)
  界面是英文的,还是没有找到中文输入法
Ps:  kubuntu  KDE界面
    ubuntu   Gnome

6.kubuntu转变成ubuntu

上网一查才知道是如此的坑爹,大家都是从ubuntu往kubuntu转,悲剧啊 只好最简单粗暴的方法

sudo apt-get install ubuntu-desktop

等了半个小时,重启发现先打开kubuntu然后ubuntu,但总算是gnome界面

7.语言设置

sudo apt-get install language-support-zh  (语言包)    已经安装过了
system  →administration →  language support 
   system    → preference  → system setting →简体中文
      重启,就KO了

这样服务器的图形界面就算安装完成

但这只是故事的开始,比如说我装了两次,一个kubuntu一个ubuntu,这两个会不会有什么冲突,比如说我现在装的东西对工程师给我们装的软件会不会有影响,比如说我现在的文件系统根目录快满了,等等,期待明天操作吧

ps:我们现在用的ion测序仪的创始人,也就是Rothberg于2007年创办这个公司,2010年被Life Technologies收购,2013年赛默飞与Life Technologies合并,然后Rothberg离开了这个公司,最富有传奇色彩的是Rothberg先后创办了四家测序公司,1999年时创立了454,现在已被罗氏收购,吃惊吧。 ion测序仪基于半导体芯片,当核苷酸加入到增长的DNA链时,H离子释放,通过这一点来实现检测,不需要激光成像仪或标记,神奇吧

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