预测与注释

• 一、基因预测
• 二、蛋白预测
• 五、注释介绍

• 六、常见的一些注释

• 八、微生物其他数据库

总篇数：33

• 2015/05/06   【1.1】宏基因组ORF预测
• 2015/05/06   【1.2】真核基因预测
• 2015/05/07   【1.3】16SrRNA的预测与鉴定
• 2015/05/07   【1.4】ncRNA注释--Rfam
• 2013/11/29   【1.5】CPC长非编码RNA的鉴定
• 2015/05/07   【1.6】tRNA的预测--tRNAscan-SE
• 2019/08/24   【2.1】蛋白质分选预测简史
• 2015/05/07   【2.2】Tat的预测
• 2015/05/07   【2.3】蛋白质跨膜结构域预测
• 2019/08/25   【2.4】信号肽的预测--SignalP
• 2014/09/25   【4.1】基因组注释
• 2014/03/11   【4.2】RAST自动注释微生物基因组
• 2014/08/06   【5.0】核酸序列转变为aa序列
• 2014/01/04   【5.1.1】MEGAN
• 2014/06/14   【5.1.2】usearch--比对，聚类，去除chimera
• 2013/12/25   【5.7.2】Goslim注释
• 2015/05/22   【5.2.1】PfamScan及pfam数据库
• 2015/05/26   【5.2.2】interproscan安装及使用
• 2014/09/22   【5.4.1】插入片段查找--isfinder
• 2019/12/30   【5.4.2】tRNA和tmRNA基因中精确定位的基因组岛的数据库（Islander）
• 2020/01/23   【5.4.3】预测RNA二级结构RNAfold
• 2014/09/25   【5.5】CAZyme的注释
• 2013/12/25   【5.7.1】基因本体论与GO注释
• 2013/12/06   【5.7.3】分子通路鉴定--KOBAS
• 2014/09/25   【5.7.4】COG注释
• 2014/01/15   【5.7.5】KAAS终结版
• 2014/09/22   【5.8】初识CRISPR
• 2015/08/23   【5.9.1】RepeatMasker
• 2017/02/06   【5.9.2】Annovar--位点注释
• 2017/02/13   【5.9.3】基于保守性和规则性的预测方法SIFT和PolyPhen
• 2020/01/01   【8.1.1】病原菌毒力因子数据库--VFDB
• 2020/01/01   【8.2】抗性基因数据库--CARD
• 2020/02/24   【8.2】DSMZ