预测与注释
- 一、基因预测
- 二、蛋白预测
- 五、注释介绍
六、常见的一些注释
八、微生物其他数据库
总篇数:33
- 2015/05/06 【1.1】宏基因组ORF预测
- 2015/05/06 【1.2】真核基因预测
- 2015/05/07 【1.3】16SrRNA的预测与鉴定
- 2015/05/07 【1.4】ncRNA注释--Rfam
- 2013/11/29 【1.5】CPC长非编码RNA的鉴定
- 2015/05/07 【1.6】tRNA的预测--tRNAscan-SE
- 2019/08/24 【2.1】蛋白质分选预测简史
- 2015/05/07 【2.2】Tat的预测
- 2015/05/07 【2.3】蛋白质跨膜结构域预测
- 2019/08/25 【2.4】信号肽的预测--SignalP
- 2014/09/25 【4.1】基因组注释
- 2014/03/11 【4.2】RAST自动注释微生物基因组
- 2014/08/06 【5.0】核酸序列转变为aa序列
- 2014/01/04 【5.1.1】MEGAN
- 2014/06/14 【5.1.2】usearch--比对,聚类,去除chimera
- 2013/12/25 【5.7.2】Goslim注释
- 2015/05/22 【5.2.1】PfamScan及pfam数据库
- 2015/05/26 【5.2.2】interproscan安装及使用
- 2014/09/22 【5.4.1】插入片段查找--isfinder
- 2019/12/30 【5.4.2】tRNA和tmRNA基因中精确定位的基因组岛的数据库(Islander)
- 2020/01/23 【5.4.3】预测RNA二级结构RNAfold
- 2014/09/25 【5.5】CAZyme的注释
- 2013/12/25 【5.7.1】基因本体论与GO注释
- 2013/12/06 【5.7.3】分子通路鉴定--KOBAS
- 2014/09/25 【5.7.4】COG注释
- 2014/01/15 【5.7.5】KAAS终结版
- 2014/09/22 【5.8】初识CRISPR
- 2015/08/23 【5.9.1】RepeatMasker
- 2017/02/06 【5.9.2】Annovar--位点注释
- 2017/02/13 【5.9.3】基于保守性和规则性的预测方法SIFT和PolyPhen
- 2020/01/01 【8.1.1】病原菌毒力因子数据库--VFDB
- 2020/01/01 【8.2】抗性基因数据库--CARD
- 2020/02/24 【8.2】DSMZ