【9.2.3】蛋白质三维结构演示-avogadro

一、简介

Avogadro是先进的分子编辑器和可视化工具,专门用于计算化学,分子建模,生物信息学,材料科学及相关领域中的跨平台使用。 它提供了灵活的高质量渲染和强大的插件体系结构。

  • 跨平台:适用于Windows,Linux和Mac OS X的分子构建器/编辑器。
  • 免费,开源:易于安装,并且所有源代码和文档都可以修改或扩展。
  • 国际性:翻译成中文,法文,德文,意大利文,俄文,西班牙文等,还有更多语言可供选择。
  • 直观:专为学生和高级研究人员而设计。
  • 快速:支持多线程渲染和计算。
  • 可扩展:开发人员的插件架构,包括渲染,交互式工具,命令和Python脚本。
  • 灵活:功能包括Open Babel导入化学文件,为多个计算化学软件包,晶体学和生物分子生成输入。

http://avogadro.cc/

下载地址:

https://sourceforge.net/projects/avogadro/

二、使用案例

2.1 小分子结构添加H原子

原始结构

“Build”– “Add Hydrogens” ,插入以后

个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

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