【7.1.2】IMGT Colliers de Perles

当用于氨基酸序列图形表示时，表述“ Collier de Perles”，“ Colliers de Perles”受版权保护。 如果使用，请参阅Ruiz, M. and Lefranc, M.-P. (2002) .

IMGT Colliers de Perles [1]是免疫球蛋白（IG）和T细胞受体（TR）的V-区域，V-DOMAIN和C-DOMAIN， 以及主要组织相容性（MH）的G-DOMAIN，基于IMGT唯一编号的2D图形表示。保守的疏水氨基酸突出显示。

IMGT Colliers de Perles还适用于IG和TR以外的链条的V-LIKE-DOMAIN和C-LIKE-DOMAIN，以及MH以外的链条的G-LIKE-DOMAIN。

IMGT序列标准颜色说明: http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/RepresentationRules/colormenu.php#CDR-IMGT

一、例子 Collier de Perles: house mouse (Mus musculus) IGHV

Legend：

• 氨基酸以单字母缩写形式显示。
• 超过50％的已分析IG和TR序列中给定位置处发现的疏水氨基酸（亲水指数为正值）和色氨酸（W）以蓝色显示。
• 所有脯氨酸（P）均显示为黄色。
• CDR-IMGT受正方形显示的氨基酸限制，该氨基酸属于相邻的FR-IMGT。 CDR3-IMGT从位置105延伸到位置117。
• 基于3D结构的IMGT Colliers de Perles缺少位置可能是由于实验数据不完整所致。
• 箭头指示beta sheets的方向及其在3D结构中的不同名称。如果实验数据不支持，则必须谨慎使用此信息。
• CDR-IMGT区域的颜色如下：CDR1-IMGT（蓝色），CDR2-IMGT（绿色），CDR3-IMGT（绿色蓝色）。
• C在23位（1st-CYS），W在41位（CONSERVED-TRP），保守的疏水性氨基酸字母在89位和C在104位（2nd-CYS）为红色。如果在这些关键位置发生氨基酸变化，该字母将保持红色。
• 根据针对V-DOMAIN的IMGT唯一编号，带阴影的圆圈或正方形对应于丢失的位置（Lefranc等，2003 PMID：12477501 PDF）。

IMGT注意：

前导肽和V-REGION之间的蛋白水解切割位点是推定的，氨基酸1分配到一个或另一个区域的不确定性。

参考资料

• http://www.imgt.org/IMGTindex/Colliers.php
• Collier de Perles: house mouse (Mus musculus) IGHV