【3.2】表位 epitope

  • 表位 (epitope),也称为抗原决定簇 (antigenic determinant),是免疫系统识别的抗原的一部分,特别是抗体,B细胞或T细胞。 例如,表位是抗体结合的抗原的特定片段。
  • 与表位(epitope)结合的抗体部分称为互补位(paratope)。

尽管表位通常是非自身蛋白质,但是来自宿主的可被识别的序列(如在自身免疫疾病的情况下)也是表位。

蛋白质抗原的表位根据其结构和与互补位(paratope)的相互作用分为构象表位(conformational epitopes)和线性表位(linear epitopes)两类。

  • 构象表位由抗原氨基酸序列的不连续部分组成。 这些表位基于抗原的3-D表面特征和形状或三级结构与互补位相互作用。 表位构象的比例是未知的
  • 线性表位基于其一级结构与互补位相互作用。 线性表位由来自抗原的连续氨基酸序列形成。

T cell epitopes

T细胞表位呈递在抗原呈递细胞( antigen-presenting cell, APC)的表面上,其中它们与MHC分子结合。 在人类中,专职抗原呈递细胞专门用于呈递MHC II类肽,而大多数有核体细胞呈现MHC I类肽。 由MHC I类分子呈递的T细胞表位通常是长度为8至11个氨基酸的肽,而MHC II类分子呈现较长的肽,长度为13-17个氨基酸,[2]和非经典的MHC分子也呈现非 - 肽表位,例如糖脂。

交叉活动 Cross-activity

表位有时是交叉反应的。 这种特性被免疫系统利用抗独特型抗体(最初由诺贝尔奖获得者Niels Kaj Jerne提出)进行调控。 如果抗体与抗原的表位结合,则互补位(paratope)可能成为另一种抗体的表位,然后该抗体与其结合。 如果这种第二抗体是IgM类,它的结合可以上调免疫反应; 如果第二抗体是IgG类,其结合可以下调免疫应答

表位映射 Epitope mapping

可以使用蛋白质微阵列以及ELISPOT或ELISA技术绘制表位。 另一项技术涉及高通量诱变(mutagenesis),一种表位作图策略,旨在改善构象表位在结构复杂蛋白上的快速定位。[3]

MHC I类和II类表位可以通过单独的计算方法可靠地预测[4],尽管并非所有的计算机T细胞表位预测算法的准确度都相同。

表位标签 Epitope tags

表位通常用于蛋白质组学和其他基因产物的研究。 使用重组DNA技术,编码被常见抗体识别的表位的基因序列可以与基因融合。 合成后,得到的表位标签允许抗体找到蛋白质或其他基因产物,使得实验室技术能够进行定位,纯化和进一步的分子鉴定。 用于此目的的常见表位是Myc标签,HA标签,FLAG标签,GST标签,6xHis [6],V5标签和OLLAS。[7] 肽也可以与形成肽的共价键的蛋白质结合,允许不可逆的固定化[8]这些策略也已成功应用于“以表位为中心”的疫苗设计的开发

新抗原决定簇 Neoantigenic determinant

新抗原决定簇是新抗原上的表位,新抗原(neoantigen)是一种新形成的抗原,以前未被免疫系统识别。[11] 新抗原通常与肿瘤抗原相关,并且存在于致癌细胞中。[12] 当蛋白质在生物化学途径(例如糖基化,磷酸化或蛋白水解)中经历进一步修饰时,可以形成新抗原,并且通过扩展,可以形成新抗原决定簇。 这通过改变蛋白质的结构,可以产生新的表位,称为新抗原决定簇,因为它们产生新的抗原决定簇。 识别需要单独的特异性抗体。

参考资料

个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

Sam avatar
About Sam
专注生物信息 专注转化医学