【3.4】Netmhc

主要组织相容性复合物II类(MHC-II)分子在专职抗原呈递细胞的表面上表达,其中它们向T辅助细胞展示肽,其协调许多宿主免疫应答的发作和结果。因此,了解MHC-II分子将呈递哪些肽对于理解T辅助细胞的活化是重要的,并且可以用于鉴定T细胞表位(T-cell epitopes)。我们在这里提出了两种MHC-II-肽结合亲和力预测方法NetMHCII和NetMHCIIpan的更新版本。这些是使用从包含HLA-DR,HLA-DQ,HLA-DP和H-2小鼠分子的免疫表位数据库(Immune Epitope Database)获得的定量MHC-肽结合亲和力数据的扩展数据集构建的。我们表明,使用这种扩展数据集的训练改善了两种方法的肽结合预测的性能。两种方法均可在 www.cbs.dtu.dk/services/NetMHCII-2.3 和 www.cbs.dtu.dk/se rvices/NetMHCIIpan-3.2 上公开获取。

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