【5.3】人类mRNA与蛋白表达量查询相关的数据库--ProteinAtlas

官网:https://www.proteinatlas.org/

人类蛋白质图谱是一项始于2003 年的瑞典项目,旨在利用各种组学 技术的整合,包括基于抗体的成像, 基于质谱的蛋白质组学,转录组学 和其他方法,对细胞,组织和器官 中的所有人类蛋白质进行定量。

该数据库数据版本更新较快,结果 具有参考价值。

  1. 组织中各基因表达量的查询
  2. 细胞系中各基因表达量的查询
  3. 疾病相关的各基因表达量的查询

二、使用流程

1.输入基因名即可进行查询 (https://www.proteinatlas.org/)

2.选择正确的基因的检索结果,然后分别选择 Tissue、Cell、Pathology查看其表达量

3.该基因在人体组织中的表达量,包括mRNA和蛋白的表达量

4.该基因在人体各个细分组织中的蛋白水平的表达量

5.该基因在人体各个细分组织中的mRNA水平的表达量(HPA & GTex的信息)

6.该基因在细胞的各个细胞器中的表达信息

7.该基因在各类细胞系中的基因表达量

8.该基因临床病人肿瘤样本中的mRNA水平的表达量(来源于TCGA数据)

9.该基因临床病人肿瘤样本中的蛋白水平的表达量(来源于HPA数据)

参考资料

  • 沈倩诚 上海宇道生物技术有限公司 《实用肿瘤生物信息学讲座》
个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

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