【3.5.2】获取蛋白质四级结构

蛋白质四级结构是独立的三级结构单元聚集形成的复合物,其中每个独立三级结构称为亚基,也称为单体(monoment)。含两个亚基的蛋白质称为二聚体(dimer);含三个亚基则称为三聚体(trimer);还有四聚体(tetramer);五聚体(pentamer);六聚体(hexamer)等。

蛋白质异常聚集导致的疾病:

诱发神经系统退行性病变的淀粉样蛋白(amyloid-protein ,A)是蛋白质序列相同但四级结构不同而诱发疾病的典型代表。阿尔兹海默病(Alzheimer disease,AD):在AD发生过程中出现淀粉样蛋白。A是由特殊水解酶对其前体蛋白的水解作用产生的。A有两种构象,一种为螺旋且可溶而存在于健康个体脑组织,此类A为单体没有四级结构;另一种为片层且是多个A聚集形成的链间片层,此类A不溶且出现在AD患者脑组织。诱发A从可溶螺旋转变为不溶片层聚集体的机制不清,但已广泛被证实这种构象转变的是AD的重要诱因。

四级结构的获取(实验方法)

  • X射线衍射法 (更精确)
  • 冷冻电子显微镜技术 (获得一个大致的影子)

蛋白质相互作用关系数据库

数据库 作用
DIP (the Database of Interacting Proteins) 实验方法测定的蛋白质之间的相互作用。
BioGRID (the Biological General Repository for Interaction Datasets) 主要收集模式生物物种中设计的蛋白质间的相互作用,是各种相互作用的数据集
STRING 实验测定已知的以及计算方法预测的蛋白质间的相互作用。

参考资料:

山东大学 生物信息学课题组荣誉出品 http://www.crc.sdu.edu.cn/bioinfo 巩晶老师课件

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