【9.1.6】通过moe对抗体批量renumber

目标:

  • 对抗体的pdb批量renumber

一、流程

1.先将大量Pdb文件导入生成一个database

(import to database是为了减少不停点击确认)

2.将database中的数据导入到seq界面中

先全选(点击见红色圈圈位置),再在任意一个mol的空格里,右键 send selected to moe

3.renumber

seq界面: “annotate”–“Antibody”–“Renumber”–“chothia”

点击下图箭头的位置,来隐藏legand

4.重命名tag

单机”Chain”选中序列,如果序列已经被选中,则出现灰色背景

打开$MOE/custom/svl/run/batch_rename2.svl,点击”OK”

可以看到tag的名字发生了改变

5.保存renumber以后的pdb

点击“Chain”选中需要保存的链,然后”File”–“save”

6.结果如下

个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

Sam avatar
About Sam
专注生物信息 专注转化医学