【2.4】分子对接库需要注意的问题

今天组会yn介绍了各种用于分子对接的数据库,后续准备将这些库集合起来,构建我们自己的库。

这里面有3个概念简单记录一下:

2D: 将下载下来的分子的平面结构,经过PP等工具处理后,去掉OH上的H原子,让分子结构带电荷,同时计算出电荷的大小,一般pH=24 适合人

3D: 对3D结构进行处理,计算出手性原子

conformation: 通过MOE/Schrodinger/OMGA等软件,尽可能获得分子不同的空间形态。

好吧,先到这里,后期把原理不上来。。

个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

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