【4.2.4】RNA二级结构可视化forna

http://rna.tbi.univie.ac.at/forna/

forna是一款功能丰富、使用方便、美观的RNA二级结构可视化工具。它允许您直接在浏览器中显示和编辑 RNA 二级结构,而无需安装任何软件。

要查看该功能的演示,请单击“添加分子”,然后单击“提交”。这显示了示例二级结构。请注意,二级结构不是必需的输入。如果未提供,将使用RNAfold计算给定序列的最小自由能 (MFE) 结构。有关更多示例,包括编辑结构、添加自定义着色信息、环状 RNA 和 PDB 文件,请参阅图库。

如果您的屏幕空间有限,您还可以将forna视为webapp。

输入:

>molecule_name
CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG
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输出:

个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

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