【1.1.1】各种各样的RNA(Versatile RNAs)
已在生物体内发现多种天然的RNA，例如转移RNA（tRNA）、信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、核小RNA（small nuclear RNA，snRNA）、核仁小RNA（small nucleolar RNA，snoRNA）、微RNA（microRNA，miRNA）、小干扰RNA（small interfereing RNA，siRNA）、小激活RNA（small activating RNA，saRNA）、长间插非编码RNA（long intervening noncoding RNA，lincRNA）、7SL RNA、向导RNA（guide RNA，gRNA）和Xist RNA等。这些RNA具有特殊的结构和功能，其中某些RNA存在于所有的生物，某些RNA是真核生物或原核生物特有的。
有时，根据RNA是否具有编码蛋白质的功能，可将RNA分为编码RNA（coding RNA）和非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA），按照这样的划分，显然mRNA 以外的所有RNA，如tRNA、rRNA、snRNA和miRNA等都属于ncRNA。而ncRNA还可以进一步分为管家ncRNA（house-keeping ncRNA）和调控ncRNA（regulatory ncRNA），前者呈组成型表达，是细胞的正常功能和生存所必需的，后者只在特定的细胞，或者在生物发育的某个阶段，或者在受到特定的外界刺激以后才表达，它们的表达能够在转录或翻译水平上影响到其他基因的表达。
- 核糖体RNA:核糖体的组份(Ribosomal RNA or rRNA : part of ribosomes)
- 信使RNA:蛋白质合成的模板(Messenger RNA or mRNA: template for protein synthesis)
- 转移RNA:运载氨基酸的工具(Transfer RNA or tRNA: carrier for the amino acids)
- 核小RNA:参与真核细胞核mRNA的剪接(Small nuclear RNA or snRNA: involved in splicing of eukaryotic mRNA)
- 核仁小RNA:参与真核细胞rRNA的后加工(Small nucleolar RNA or snoRNA: involved in eukaryotic rRNA processing)
- 干扰RNA，包括微RNA和小干扰RNA:干扰真核细胞内特定mRNA的翻译 (Interference RNA or RNAi, including microRNA and siRNA, interferes withtranslation of specific mRNA in Eukaryotic cells)
- Xist RNA:导致雌性哺乳动物体细胞内一条X染色体的失活(Xist RNA: causes the inactivation of one X chromosome in female mammals)
- 7SL RNA:信号识别颗粒的一部分，参与蛋白质的分拣和分泌(7SL RNA: part of signal recognition particle or SRP, involved in sorting and secretion of proteins)
- 表达调控的（miRNA, piRNA, siRNA, lncRNA, riboSwitch等）
- 其他RNA(Other RNAs; DNA复制的（例如Y-RNA）；催化作用的（例如RNase P）；RNA剪接(例如SmY-RNA)；还有许多不知道有什么用的环状RNA（circRNA）)
二、长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)
是一类不编码蛋白的RNA分子，长度在200 bp以上，起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控，尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等，图1所示。随着高通量测序技术的发展，越来越多的lncRNA被注释，但是绝大多数的lncRNA的功能仍然不清楚，因此lncRNA的研究是一片非常广阔的未知领域，具有极大的研究价值和意义。
参考资料
- 南京大学 杨荣武老师 《结构生物学》课件
- http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=472757&do=blog&id=1207925
