Mapping
总篇数:27
- 2019/02/14 【1.0】alignment和mapping区别
- 2017/01/21 【1.1】打分矩阵
- 2017/01/21 【1.2】一致度、相似度和同源度
- 2017/01/21 【2.1】序列俩俩比较-打点法
- 2017/01/21 【2.2】序列比对算法介绍
- 2019/09/06 【2.3】biopython pairwise2实现两两序列比对
- 2018/01/17 【3.1】多序列比对
- 2017/01/21 【4.1】在线双序列比对
- 2017/01/21 【5.1】blast原理介绍(序列数据库的搜索)
- 2017/01/21 【5.2】blast数据库知多少
- 2015/05/16 【5.3】blast简介及参数设置
- 2019/08/02 【5.4】Position-Specific Iterated (PSI)-BLAST
- 2018/10/11 【5.4】igblast简介及参数设置
- 2015/05/26 【6.1】bowtie2
- 2017/01/17 【6.2】samtools
- 2017/01/18 【6.3】bedtools
- 2014/01/15 【6.4】hmmer
- 2019/12/15 【6.5】根据坐标提取序列(samtools/fastacmd/twoBitToFa)
- 2020/10/08 【7.1】基因组相似性(ANI)计算--FastANI
- 2020/11/05 【7.2】Reads map到基因组--Fastv
- 2020/10/12 【8.1】基因组定位的转换(liftover)
- 2020/10/11 【8.2】基因组坐标转基因名(pyensembl)
- 2018/01/17 【9.1】寻找保守序列-WebLogo(序列标识图)
- 2018/01/17 【9.2】寻找保守序列-MEME(序列基序)
- 2018/01/17 【9.3】寻找保守序列-PRINTS指纹图谱数据库
- 2019/06/05 【4.7.1.1】蛋白结构比对的进展和挑战
- 2019/02/13 【4.7.1.4】MICAN--基于蛋白结构的比对