【3】数据分析-1-数据的处理--numpy--4--数据读写

方法一:csv文件

np.savetxt(frame, array, fmt='%.18e', delimiter=None)
frame : 文件、字符串或产生器,可以是.gz或.bz2的压缩文件
array : 存入文件的数组
fmt : 写入文件的格式,例如:%d %.2f %.18e
delimiter : 分割字符串,默认是任何空格

np.loadtxt(frame, dtype=np.float, delimiter=None, unpack=False)
frame : 文件、字符串或产生器,可以是.gz或.bz2的压缩文件
dtype : 数据类型,可选
delimiter : 分割字符串,默认是任何空格
unpack : 如果True,读入属性将分别写入不同变量

CSV只能有效存储一维和二维数组

np.savetxt() np.loadtxt()只能有效存取一维和二维数组

方法二:多维数据的存取

a.tofile(frame, sep='', format='%s')
frame : 文件、字符串
sep : 数据分割字符串,如果是空串,写入文件为二进制
format : 写入数据的格式

a.tofile(frame, sep=‘,‘, format='%s') 形成了一个文本文件(
a.tofile(frame, format='%s') 不指定sep,形成的一个二进制文件

np.fromfile(frame, dtype=float, count=‐1, sep='')
frame : 文件、字符串
dtype : 读取的数据类型
count : 读入元素个数,‐1表示读入整个文件
sep : 数据分割字符串,如果是空串,写入文件为二进制

维度信息会丢失,需要通过reshape来找回维度信息

该方法需要读取时知道存入文件时数组的维度和元素类型 a.tofile()和np.fromfile()需要配合使用 可以通过元数据文件来存储额外信息

方法三

np.save(fname, array) 或 np.savez(fname, array)

  • fname : 文件名,以.npy为扩展名,压缩扩展名为.npz
  • array : 数组变量

np.load(fname)

  • fname : 文件名,以.npy为扩展名,压缩扩展名为.npz
个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn

Sam avatar
About Sam
专注生物信息 专注转化医学