【6.5.1】mothur多样性的几个指数
测序深度指数,丰富度指数(chao,ace),多样性指数 shannon
chao(http://www.mothur.org/wiki/Chao)
LCI = Lower bound of confidence interval
UCI = Upper bound of confidence interval
ps:
尽管知道了ace,chao是个什么东西,但是lci,hci又是什么呢,不同的算法吗?先留下一个悬念。
参考资料
- http://zh.wikipedia.org/wiki/多样性指数
- 百度百科 http://baike.baidu.com/view/3850035.htm
- 文献:生物群落的物种多样性研究综述
- 文献:苏打盐碱地桑树/大豆间作的土壤微生物多样性
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