NGS

很赞的学习资料

刘小乐老师的课程：
https://liulab-dfci.github.io/teaching
https://liulab-dfci.github.io/bioinfo-combio/intro.html

一、基本概念
二、测序技术
三、数据中一些概念
四、方法与模型
五、测序应用
六、Nanopore
九、生信分析流程框架
9.3 CWL
9.3.5 CWL 新手教学
9.4 nextflow

总篇数：27

2018/01/15 【1.1】什么是生物信息学
2015/07/19 【1.2】宏基因组学
2015/05/11 【2.1】高通量测序领域常用名词解释
2013/11/04 【2.2】测序技术发展概况
2015/05/11 【2.3】单端测序与双末端测序
2022/05/01 【2.4】illumina 二代测序原理及过程
2017/05/24 【3.1】index基因组
2017/01/20 【3.2】NGS中重要的几个指标（Metrics）
2013/10/29 【4.1】隐马尔可夫模型建立预测模型
2013/11/29 【4.2】RNA差异表达与聚类分析
2013/12/04 【4.3】变量筛选和聚类分析的操作
2022/03/09 【5.1】ATAC-seq
2022/04/28 【5.2】ARC-seq
2022/09/16 【9.1】生信分析流程框架概述
2022/09/17 【9.3.1】cwl 概况
2022/09/18 【9.3.1.1】YAML
2022/09/19 【9.3.1.1】CWL命令行工具
2022/09/20 【9.3.1.1】CWL inputs
2022/09/22 【9.3.1.5】CWL其他参数
2022/09/30 【9.3.2.3】CWL--Containers
2022/10/01 【9.3.5.1】CWL入门--介绍
2022/10/02 【9.3.5.2】CWL and Shell Tools
2022/10/03 【9.3.5.3】Developing Multi-Step Workflows
2022/10/03 【9.3.5.4】bio-cwl库
2022/10/04 【9.3.5.5】Debugging Workflows
2022/10/06 【9.4.1.1】Nextflow
2022/10/07 【9.4.1.5】Nextflow process