5.1 进化树与heatmap合并
上图是花了将近一个星期的所得。简单总结一下。
- 用qiime分析流程获得每个样品中的otu的丰度,以及对应的物种信息;
- 用R做出在样品中有丰度超过1%的的Otu的热电图;
- 选却相应的Otu中的代表序列,用Megan做出进化树
- 用ps将两张图合并(注意ps核心思想是对图层的处理)
Ps:
感谢小芮哥,胡哥以及qiime论坛对我qiime分析流程的指导 感谢R论坛给我R上的指导 感谢然然同学对我ps处理上的指导
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个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn
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