【4.4.3.5】NetMHCcons

我们对三种最先进的 MHC 肽结合预测方法（NetMHC、NetMHCpan 和 PickPocket）的组合进行了深入分析。我们证明，当所讨论的等位基因包含在训练中并且具有至少 50 个数据点和至少 10 个结合物的特征时，NetMHC 和 NetMHCpan 的简单组合可提供最高性能。否则，NetMHCpan 是最好的预测器。当等位基因尚未表征时，性能取决于与训练数据的距离。当训练集中存在近邻时，NetMHCpan 具有最高性能，而对于具有更远邻的等位基因，NetMHCpan 和 PickPocket 的组合优于这两种方法中的任何一种。 因此NetMHCcons 是这三种打分工具的综合。

公式：

效果：

参考资料

• NetMHCcons: a consensus method for the major histocompatibility complex class I predictions