【8.2.2】microRNA组织表达
MiR 是大约 21-23 个碱基的小单链 RNA。它们是通过 Dicer 酶加工大约 70-90 个具有发夹结构的单链 RNA 前体产生的(Khandelwal 等,2019)。
MicroRNA (miRNA) 代表了一类新的基因产物,据信它们通过与 3' 非翻译区 (UTR) 中的反义互补位点结合来特异性地控制目标 mRNA 的翻译
- 第一个确认的 miR 是在线虫中发现的 lin-4 和 let-7。
- 随后,几个研究小组开始研究人类、果蝇和植物,并且已经从各种物种中鉴定出数百个 miR(He 和 Wang,2012)。
MiRs在体内参与细胞增殖与凋亡、生长发育、代谢活化、DNA修复等一系列生物学过程,与各种疾病尤其是肿瘤的发生发展密切相关。 MiRs主要通过切断靶基因的RNA分子、抑制靶基因翻译和抑制结合来调节靶基因mRNA(Aalaei-Andabili和Rezaei,2016)。
二、组织特异表达
已经检测到 miRs 在哺乳动物脑组织中的特异性表达或富集,例如 miR-9、miR-124 和 miR-132(Lagos-Quintana 等,2002;Lopez-Ramirez 和 Nicoli,2014)。
miR-1
此前,Northern 分析显示 miR-1 在成人心脏中强烈表达,但在人脑、肝脏、肾脏、肺或结肠中不表达[5]. 在这里,我们表明 miR-1 占心脏中发现的所有小鼠 miRNA 的 45%,但 miR-1 在肝脏和中脑中仍以低水平表达,尽管它仍然无法通过 Northern 分析检测到。在小鼠中发现了 miR-1 的三个拷贝或多态等位基因。小鼠和人类之间组织特异性 miR-1 表达的保守性为该 miRNA 的保守调节作用提供了额外的证据。
miR-122
在肝脏中,miR-122 的变体占所有克隆 miRNA 的 72%,并且在所有其他分析的组织中未检测到 miR-122。
MiR-124
例如,MiR-124 在成人大脑中占总 mRNA 的 25-48%,并且在除垂体之外的所有大脑区域中都高度表达。 MiR-124 也被认为是神经元特异性 miR,因为它主要在神经元细胞中表达(Lagos-Quintana 等,2002;Mishima 等,2007)。 MiR-124 在神经发育和成体神经发生过程中暂时上调(Smirnova 等,2005;Cheng 等,2009)。该 miR 在调节突触可塑性和记忆信号分子方面也起着关键作用(Fischbach 和 Carew,2009)。 MiR-124 在小胶质细胞中也高度表达,它参与小胶质细胞静止的调节(Ponomarev 等,2011;Saraiva 等,2017)。
miR-143
在脾脏中,miR-143 似乎是最丰富的,频率约为 30%
miR-142-as
在结肠中,miR-142-as 被多次克隆并且出现频率为 30%。
概括
在小肠中,获得的 miRNA 序列太少,无法进行统计分析。这是由于该组织中有很强的 RNase 活性,这导致大量非编码RNA(例如rRNA)的显着分解,因此克隆序列中miRNA的比例非常低。出于同样的原因,没有从胰腺中获得 miRNA 序列。
参考资料
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