【1.5.2】使用命令行参数运行R程序(Args)
有时需要反复执行一段R代码,并使用不同得参数,可以将代码用文本编辑器写为R脚本(*.R),在第一行加入
Args<- commandArgs()
然后通过
Rscript *.R 参数1 参数2 …
执行脚本。
脚本中
Args[6]==参数1
Args[7]==参数2
...
输出commandArgs()可以看到前五个分别是:
[1] "/opt/blc/genome/biosoft/R/lib64/R/bin/exec/R" #这个是R路径
[2] "--slave"
[3] "--no-restore"
[4] "--file=test.r"
[5] "--args"
所以第一个参数从<span style="color: #ff0000;">Args[6]</span>开始
例子:
文件test.R加入:
Args x=seq(0,20,by=0.5)
y=dchisq(x,3)
#plot(x,y,type="l",col="blue")
Args[0]
Args[6]
运行
Rscript test.R 111 122
参考资料:
这里是一个广告位,,感兴趣的都可以发邮件聊聊:tiehan@sina.cn
个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn
个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn