【8.4.1】ViPR 病毒数据库

ViPRvirus pathogen database and analysis resource

官网： https://www.viprbrc.org/brc/home.spg?decorator=vipr

• ViPR 包含属于沙粒病毒科、布尼亚病毒科、杯状病毒科、冠状病毒科、黄病毒科、丝状病毒科、肝炎病毒科、疱疹病毒科、副粘病毒科、小核糖核酸病毒科、痘病毒科、呼肠孤病毒科、弹状病毒科和披膜病毒科家庭，并计划在未来支持更多的病毒家庭。
• ViPR 捕获各种类型的信息，包括序列记录、基因和蛋白质注释、3D 蛋白质结构、免疫表位位置、临床和监测元数据以及来自比较基因组学分析的新数据。
• 还提供了用于元数据驱动的统计序列分析、多序列比对、系统发育树构建、BLAST 比较和序列变异确定的分析和可视化工具。

其他数据库：

• 流感研究数据库 (IRD, www.fludb.org )
• 人类免疫缺陷病毒序列数据库 ( http://www.hiv.lanl.gov )
• 病毒病原体数据库和分析资源 (ViPR; www.ViPRbrc.org ) 是分类为 A-C 优先病原体或对公众健康有不利影响的病毒的可公开访问的存储库 ( http://www.niaid.nih.gov/topics/biodefenserelated/biodefense/research/pages/cata.aspx ）

参考资料

• 2011，ViPR: an open bioinformatics database and analysis resource for virology research 。 https://academic.oup.com/nar/article/40/D1/D593/2903451?login=true