【9.1.6】通过moe对抗体批量renumber
目标:
- 对抗体的pdb批量renumber
一、流程
1.先将大量Pdb文件导入生成一个database
(import to database是为了减少不停点击确认)
2.将database中的数据导入到seq界面中
先全选(点击见红色圈圈位置),再在任意一个mol的空格里,右键 send selected to moe
3.renumber
seq界面: “annotate”–“Antibody”–“Renumber”–“chothia”
点击下图箭头的位置,来隐藏legand
4.重命名tag
单机"Chain"选中序列,如果序列已经被选中,则出现灰色背景
打开$MOE/custom/svl/run/batch_rename2.svl,点击"OK"
可以看到tag的名字发生了改变
5.保存renumber以后的pdb
点击“Chain”选中需要保存的链,然后"File"–“save”
6.结果如下
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个人公众号,比较懒,很少更新,可以在上面提问题,如果回复不及时,可发邮件给我: tiehan@sina.cn
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