【9.1.3】moe序列标记

打开pdb文件略。。

1.选中序列结构，如下图，所示，粉色的标记代表着C链被选中了（半粉代表部分选中）

2.然后进行标记，选中跟C链离得近的残基，标注出来

此时可以看到 C链全选中，A,B 部分选中

此时可以看到 C链全选中，A,B 部分选中

3.鼠标放在蓝色背景标记的位置，单价右键，选中residues,选中标记的颜色

4.进行序列复制

鼠标选中xxxx

edit– copy as – moe （如果不想复制结果信息，就直接fst格式就可以了，在序列上可以通过粗细看出来）

然后 ctrl +v 复制，得到这个

5.最后的结果为：

第一行是CDR标记，第二行为临近点，第三行为选中的序列的标记

上述的步骤中省略掉了很多，比如：

1. cdr注释： annoate–antibody–cdr;
2. 复制2次；
3. ctrl + L 来选择序列，然后在选择的序列鼠标右键标记residues颜色
4. 比如双击序列是全选，再次双击就是取消选中
5. 比如选中序列，选择residues的标记为None
6. 选择的残基，然后 select – set create – 就可以将他们保存到操作界面中，以后方便调取 （这个很吊呀）
7. 用选择的的残基进行superpose。 选择 selected residues ， structure only 进行superpose

具体我就不说了。。