【5.3.3】蛋白质分子表面性质

1. 表面形状(VMD：SURF representation)
2. 表面电荷分布（electrostatic potential）
3. 表面残基可溶性（solvent accessibility），即残基与溶剂接触的程度，也就是哪些地方是掩埋在内部的（buried）;哪些地方是露在表面的（eposed）;哪些地方介于掩埋与暴露之间的重点状态（intermediate）。

一、VMD 程序

下载APBS插件

VMD不认识中文，路径中不要有中文

PS: 回头自己多加练习VMD吧

参考资料：

山东大学 生物信息学课题组荣誉出品 http://www.crc.sdu.edu.cn/bioinfo 巩晶老师课件