【4.2.5】预测RNA二级结构LinearPartition

一、安装

latex一直缺库,最后直接用的线上的latex工具:

二、使用

[root@4c2bdfc52747 LinearPartition]# echo GGGCUCGUAGAUCAGCGGUAGAUCGCUUCCUUCGCAAGGAAGCCCUGGGUUCAAAUCCCAGCGAGUCCACCA | ./linearpartition -V -M --rewrite test.bpp --mea_prefix test.ss

三、我得案例

cat test/cfl.fa | ./linearpartition -V -M --rewrite test/cfl.bpp --mea_prefix test/cfl.ss
cat test/cfl.ss_1 | ./draw_bpp_plot test/cfl.bpp

参考资料

药企,独角兽,苏州。团队长期招人,感兴趣的都可以发邮件聊聊:tiehan@sina.cn
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