Annoation

总篇数：35

2014/09/25 【1.1】基因组注释
2015/08/23 【2.1.1】RepeatMasker
2014/06/14 【3.3.5】usearch--比对，聚类，去除chimera
2022/12/27 【1.1.1】centos8安装Rosetta
2014/08/06 【3.4.1】核酸序列转变为氨基酸序列
2014/01/04 【3.5.3】MEGAN
2021/09/15 【3.5.4】使用 RAxML 构建进化树
2022/02/25 【3.6.1】宏基因组分类注释的工具比较
2014/03/11 【4.2】RAST自动注释微生物基因组
2017/02/06 【4.1.2】Annovar--位点注释
2017/02/13 【4.3】基于保守性和规则性的预测方法SIFT和PolyPhen
2020/01/23 【4.2.1】预测RNA二级结构RNAfold
2021/05/06 【4.2.2】预测RNA二级结构RNAstructureWeb
2021/05/08 【4.2.4】RNA二级结构可视化forna
2021/08/11 【4.2.5】预测RNA二级结构mfold
2022/11/05 【4.2.6】预测RNA二级结构LinearPartition
2021/07/28 【4.3.1】来自大型开放实验室的RNA设计规则(EteRNABot、eternagame)
2021/07/29 【4.3.2】AntaRNA
2022/12/15 【4.6.1】预测microRNA结合位点--miRanda
2022/02/03 【4.6.1】预测RNA-RNA相互作用--INTARNA
2013/12/25 【5.2.1.4】Goslim注释
2015/05/22 【5.2.1.1】PfamScan及pfam数据库
2015/05/26 【5.2.1.2】interproscan安装及使用
2013/12/25 【5.2.1.3】基因本体论与GO注释
2014/09/25 【5.2.1.5】CAZyme的注释
2014/09/25 【5.2.1.6】COG注释
2021/09/07 【5.2.1.7】蛋白分类--UProC
2013/12/06 【5.3.1】分子通路鉴定--KOBAS
2014/01/15 【5.3.2】KAAS终结版
2014/09/22 【6.1.1】插入片段查找--isfinder
2014/09/22 【6.2.1】初识CRISPR
2020/01/01 【6.6.1】抗性基因数据库--CARD
2020/01/01 【6.6.2】病原菌毒力因子数据库--VFDB
2020/02/24 【6.8.1】DSMZ
2021/09/03 【7.2.2】抗生素和次级代谢物分析--antiSMASH